Dziwne… standardowo okno można zamknąć, bądź też zmaksymalizować (dwuklik na belce tytułowej)

# yum install gnome-tweak-tool
$ gnome-tweak-tool

Opcja którą szukamy to:
Powłoka -> uporządkowanie przycisków na pasku tytułowym

Fakt, że znikanie okien też jest jakieś takie do dupy, bo nie widać ich po zniknięciu na żadnym pasku… no ale, lepsze to niż nic.

yum install gnome-shell-extension-window-list